Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.4 ms