Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 APTX-203ENST00000379813 1121 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 AC027176.2-201ENST00000559166 746 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 AC013731.1-201ENST00000604340 883 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 AL035563.1-201ENST00000609087 1539 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 AL356273.1-201ENST00000441261 1152 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 AL357093.1-201ENST00000556926 458 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 AC236972.3-202ENST00000620734 1222 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 AP003497.2-201ENST00000624220 967 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 AC093390.2-202ENST00000638236 976 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 CU633906.2-205ENST00000624847 1468 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 COX7B2-202ENST00000396533 617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 AL646090.1-201ENST00000449928 492 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 AC007423.1-201ENST00000605009 627 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms