Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms