Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms