Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OC90Q02509 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
OC90Q02509 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
OC90Q02509 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
OC90Q02509 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
OC90Q02509 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OC90Q02509 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OC90Q02509 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OC90Q02509 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
OC90Q02509 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OC90Q02509 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
OC90Q02509 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OC90Q02509 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
OC90Q02509 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OC90Q02509 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OC90Q02509 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OC90Q02509 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OC90Q02509 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OC90Q02509 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
OC90Q02509 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
OC90Q02509 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OC90Q02509 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OC90Q02509 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OC90Q02509 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OC90Q02509 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OC90Q02509 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
OC90Q02509 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
OC90Q02509 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
OC90Q02509 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
OC90Q02509 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
OC90Q02509 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OC90Q02509 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OC90Q02509 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
OC90Q02509 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OC90Q02509 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
OC90Q02509 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OC90Q02509 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
OC90Q02509 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
OC90Q02509 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
OC90Q02509 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OC90Q02509 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OC90Q02509 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OC90Q02509 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OC90Q02509 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OC90Q02509 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OC90Q02509 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OC90Q02509 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OC90Q02509 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OC90Q02509 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OC90Q02509 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OC90Q02509 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OC90Q02509 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OC90Q02509 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OC90Q02509 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OC90Q02509 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OC90Q02509 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OC90Q02509 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
OC90Q02509 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
OC90Q02509 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
OC90Q02509 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OC90Q02509 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OC90Q02509 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OC90Q02509 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OC90Q02509 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OC90Q02509 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OC90Q02509 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OC90Q02509 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OC90Q02509 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OC90Q02509 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OC90Q02509 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OC90Q02509 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OC90Q02509 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OC90Q02509 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OC90Q02509 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OC90Q02509 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OC90Q02509 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OC90Q02509 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OC90Q02509 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OC90Q02509 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OC90Q02509 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OC90Q02509 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OC90Q02509 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OC90Q02509 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OC90Q02509 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OC90Q02509 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OC90Q02509 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OC90Q02509 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OC90Q02509 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OC90Q02509 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OC90Q02509 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OC90Q02509 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OC90Q02509 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OC90Q02509 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OC90Q02509 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OC90Q02509 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OC90Q02509 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OC90Q02509 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OC90Q02509 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OC90Q02509 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OC90Q02509 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms