Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms