Protein–RNA interactions for Protein: Q01814

ATP2B2, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B2Q01814 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP2B2Q01814 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP2B2Q01814 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP2B2Q01814 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP2B2Q01814 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP2B2Q01814 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP2B2Q01814 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP2B2Q01814 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP2B2Q01814 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP2B2Q01814 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP2B2Q01814 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP2B2Q01814 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP2B2Q01814 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP2B2Q01814 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP2B2Q01814 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP2B2Q01814 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP2B2Q01814 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP2B2Q01814 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP2B2Q01814 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP2B2Q01814 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP2B2Q01814 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP2B2Q01814 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP2B2Q01814 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP2B2Q01814 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP2B2Q01814 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP2B2Q01814 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP2B2Q01814 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP2B2Q01814 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP2B2Q01814 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP2B2Q01814 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP2B2Q01814 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP2B2Q01814 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP2B2Q01814 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP2B2Q01814 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP2B2Q01814 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP2B2Q01814 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP2B2Q01814 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP2B2Q01814 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP2B2Q01814 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP2B2Q01814 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP2B2Q01814 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP2B2Q01814 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP2B2Q01814 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP2B2Q01814 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ATP2B2Q01814 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ATP2B2Q01814 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ATP2B2Q01814 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ATP2B2Q01814 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP2B2Q01814 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP2B2Q01814 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP2B2Q01814 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP2B2Q01814 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP2B2Q01814 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP2B2Q01814 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP2B2Q01814 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP2B2Q01814 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP2B2Q01814 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP2B2Q01814 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP2B2Q01814 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP2B2Q01814 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP2B2Q01814 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP2B2Q01814 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP2B2Q01814 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP2B2Q01814 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP2B2Q01814 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP2B2Q01814 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP2B2Q01814 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP2B2Q01814 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP2B2Q01814 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP2B2Q01814 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP2B2Q01814 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP2B2Q01814 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP2B2Q01814 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP2B2Q01814 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP2B2Q01814 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP2B2Q01814 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP2B2Q01814 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP2B2Q01814 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP2B2Q01814 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP2B2Q01814 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP2B2Q01814 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP2B2Q01814 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP2B2Q01814 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP2B2Q01814 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP2B2Q01814 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP2B2Q01814 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP2B2Q01814 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP2B2Q01814 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP2B2Q01814 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP2B2Q01814 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP2B2Q01814 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP2B2Q01814 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP2B2Q01814 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP2B2Q01814 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP2B2Q01814 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP2B2Q01814 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP2B2Q01814 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP2B2Q01814 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP2B2Q01814 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP2B2Q01814 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms