Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms