Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms