Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms