Protein–RNA interactions for Protein: Q00056

HOXA4, Homeobox protein Hox-A4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4Q00056 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXA4Q00056 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXA4Q00056 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXA4Q00056 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXA4Q00056 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXA4Q00056 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HOXA4Q00056 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXA4Q00056 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXA4Q00056 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXA4Q00056 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms