Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms