Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABCE1P61221 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABCE1P61221 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABCE1P61221 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABCE1P61221 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABCE1P61221 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABCE1P61221 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABCE1P61221 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABCE1P61221 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABCE1P61221 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABCE1P61221 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABCE1P61221 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABCE1P61221 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABCE1P61221 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABCE1P61221 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ABCE1P61221 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ABCE1P61221 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABCE1P61221 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABCE1P61221 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABCE1P61221 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABCE1P61221 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABCE1P61221 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABCE1P61221 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABCE1P61221 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABCE1P61221 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABCE1P61221 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ABCE1P61221 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABCE1P61221 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABCE1P61221 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABCE1P61221 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABCE1P61221 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABCE1P61221 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABCE1P61221 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABCE1P61221 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABCE1P61221 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABCE1P61221 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABCE1P61221 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABCE1P61221 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABCE1P61221 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABCE1P61221 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABCE1P61221 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ABCE1P61221 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ABCE1P61221 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ABCE1P61221 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ABCE1P61221 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ABCE1P61221 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ABCE1P61221 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ABCE1P61221 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ABCE1P61221 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ABCE1P61221 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ABCE1P61221 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ABCE1P61221 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ABCE1P61221 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ABCE1P61221 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ABCE1P61221 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ABCE1P61221 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms