Protein–RNA interactions for Protein: P55212

CASP6, Caspase-6, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP6P55212 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP6P55212 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP6P55212 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP6P55212 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP6P55212 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP6P55212 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP6P55212 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP6P55212 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP6P55212 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP6P55212 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP6P55212 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP6P55212 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP6P55212 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP6P55212 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP6P55212 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP6P55212 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP6P55212 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP6P55212 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP6P55212 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP6P55212 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP6P55212 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP6P55212 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP6P55212 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP6P55212 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP6P55212 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP6P55212 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP6P55212 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP6P55212 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP6P55212 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP6P55212 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP6P55212 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP6P55212 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP6P55212 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP6P55212 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP6P55212 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP6P55212 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP6P55212 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP6P55212 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP6P55212 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP6P55212 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP6P55212 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP6P55212 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP6P55212 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP6P55212 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP6P55212 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP6P55212 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP6P55212 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP6P55212 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP6P55212 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP6P55212 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP6P55212 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP6P55212 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP6P55212 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP6P55212 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP6P55212 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP6P55212 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP6P55212 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP6P55212 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP6P55212 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP6P55212 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP6P55212 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP6P55212 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP6P55212 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP6P55212 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP6P55212 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP6P55212 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP6P55212 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP6P55212 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP6P55212 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP6P55212 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP6P55212 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP6P55212 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP6P55212 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP6P55212 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP6P55212 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP6P55212 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP6P55212 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP6P55212 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP6P55212 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP6P55212 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP6P55212 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP6P55212 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP6P55212 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP6P55212 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP6P55212 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP6P55212 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP6P55212 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP6P55212 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP6P55212 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP6P55212 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP6P55212 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP6P55212 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP6P55212 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP6P55212 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP6P55212 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP6P55212 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP6P55212 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP6P55212 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP6P55212 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP6P55212 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms