Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
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PGGT1BP53609 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
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