Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERFP50548 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERFP50548 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERFP50548 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERFP50548 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERFP50548 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERFP50548 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERFP50548 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERFP50548 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERFP50548 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERFP50548 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERFP50548 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERFP50548 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERFP50548 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERFP50548 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERFP50548 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERFP50548 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERFP50548 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERFP50548 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERFP50548 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERFP50548 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERFP50548 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERFP50548 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERFP50548 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERFP50548 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERFP50548 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERFP50548 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERFP50548 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERFP50548 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERFP50548 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERFP50548 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERFP50548 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERFP50548 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERFP50548 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERFP50548 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERFP50548 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERFP50548 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERFP50548 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERFP50548 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERFP50548 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERFP50548 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERFP50548 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERFP50548 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERFP50548 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERFP50548 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERFP50548 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERFP50548 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERFP50548 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERFP50548 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERFP50548 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERFP50548 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERFP50548 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERFP50548 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERFP50548 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERFP50548 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERFP50548 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERFP50548 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERFP50548 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERFP50548 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ERFP50548 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERFP50548 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERFP50548 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERFP50548 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERFP50548 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ERFP50548 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERFP50548 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERFP50548 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERFP50548 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERFP50548 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERFP50548 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERFP50548 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERFP50548 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERFP50548 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERFP50548 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERFP50548 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERFP50548 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERFP50548 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERFP50548 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERFP50548 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERFP50548 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERFP50548 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERFP50548 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERFP50548 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERFP50548 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERFP50548 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERFP50548 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERFP50548 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ERFP50548 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERFP50548 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERFP50548 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERFP50548 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERFP50548 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERFP50548 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERFP50548 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERFP50548 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERFP50548 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERFP50548 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERFP50548 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERFP50548 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERFP50548 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms