Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC4A3P48751 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC4A3P48751 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC4A3P48751 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC4A3P48751 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC4A3P48751 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC4A3P48751 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC4A3P48751 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC4A3P48751 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC4A3P48751 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC4A3P48751 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC4A3P48751 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC4A3P48751 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC4A3P48751 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC4A3P48751 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC4A3P48751 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC4A3P48751 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC4A3P48751 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC4A3P48751 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC4A3P48751 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC4A3P48751 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC4A3P48751 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC4A3P48751 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC4A3P48751 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC4A3P48751 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC4A3P48751 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC4A3P48751 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC4A3P48751 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC4A3P48751 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC4A3P48751 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC4A3P48751 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC4A3P48751 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC4A3P48751 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC4A3P48751 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC4A3P48751 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC4A3P48751 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC4A3P48751 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC4A3P48751 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC4A3P48751 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC4A3P48751 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC4A3P48751 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC4A3P48751 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC4A3P48751 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC4A3P48751 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC4A3P48751 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC4A3P48751 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC4A3P48751 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC4A3P48751 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC4A3P48751 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC4A3P48751 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC4A3P48751 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC4A3P48751 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC4A3P48751 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC4A3P48751 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC4A3P48751 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC4A3P48751 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC4A3P48751 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC4A3P48751 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC4A3P48751 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC4A3P48751 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC4A3P48751 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC4A3P48751 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC4A3P48751 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC4A3P48751 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC4A3P48751 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC4A3P48751 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC4A3P48751 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC4A3P48751 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC4A3P48751 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC4A3P48751 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC4A3P48751 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC4A3P48751 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC4A3P48751 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC4A3P48751 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC4A3P48751 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC4A3P48751 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC4A3P48751 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC4A3P48751 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC4A3P48751 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC4A3P48751 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC4A3P48751 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC4A3P48751 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC4A3P48751 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC4A3P48751 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC4A3P48751 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC4A3P48751 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC4A3P48751 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC4A3P48751 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC4A3P48751 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC4A3P48751 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC4A3P48751 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC4A3P48751 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC4A3P48751 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC4A3P48751 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC4A3P48751 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC4A3P48751 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC4A3P48751 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC4A3P48751 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC4A3P48751 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC4A3P48751 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms