Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms