Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
XCR1P46094 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
XCR1P46094 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
XCR1P46094 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
XCR1P46094 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
XCR1P46094 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
XCR1P46094 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
XCR1P46094 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
XCR1P46094 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
XCR1P46094 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
XCR1P46094 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
XCR1P46094 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
XCR1P46094 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
XCR1P46094 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
XCR1P46094 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
XCR1P46094 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
XCR1P46094 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
XCR1P46094 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
XCR1P46094 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
XCR1P46094 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
XCR1P46094 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
XCR1P46094 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
XCR1P46094 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
XCR1P46094 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
XCR1P46094 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
XCR1P46094 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
XCR1P46094 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
XCR1P46094 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
XCR1P46094 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
XCR1P46094 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
XCR1P46094 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
XCR1P46094 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
XCR1P46094 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
XCR1P46094 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
XCR1P46094 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
XCR1P46094 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
XCR1P46094 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
XCR1P46094 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
XCR1P46094 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
XCR1P46094 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
XCR1P46094 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
XCR1P46094 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
XCR1P46094 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
XCR1P46094 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
XCR1P46094 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
XCR1P46094 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
XCR1P46094 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
XCR1P46094 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
XCR1P46094 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
XCR1P46094 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
XCR1P46094 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
XCR1P46094 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
XCR1P46094 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
XCR1P46094 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
XCR1P46094 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
XCR1P46094 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
XCR1P46094 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
XCR1P46094 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
XCR1P46094 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
XCR1P46094 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
XCR1P46094 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
XCR1P46094 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
XCR1P46094 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
XCR1P46094 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
XCR1P46094 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
XCR1P46094 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
XCR1P46094 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
XCR1P46094 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
XCR1P46094 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
XCR1P46094 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
XCR1P46094 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
XCR1P46094 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
XCR1P46094 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
XCR1P46094 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
XCR1P46094 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
XCR1P46094 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
XCR1P46094 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
XCR1P46094 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
XCR1P46094 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
XCR1P46094 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
XCR1P46094 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
XCR1P46094 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
XCR1P46094 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
XCR1P46094 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
XCR1P46094 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
XCR1P46094 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
XCR1P46094 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
XCR1P46094 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
XCR1P46094 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
XCR1P46094 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
XCR1P46094 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
XCR1P46094 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
XCR1P46094 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
XCR1P46094 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
XCR1P46094 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
XCR1P46094 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
XCR1P46094 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
XCR1P46094 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
XCR1P46094 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
XCR1P46094 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms