Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms