Protein–RNA interactions for Protein: P42574

CASP3, Caspase-3, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP3P42574 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP3P42574 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP3P42574 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP3P42574 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP3P42574 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP3P42574 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP3P42574 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP3P42574 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP3P42574 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP3P42574 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP3P42574 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP3P42574 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP3P42574 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP3P42574 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP3P42574 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP3P42574 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP3P42574 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP3P42574 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP3P42574 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP3P42574 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP3P42574 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP3P42574 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP3P42574 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP3P42574 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP3P42574 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP3P42574 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP3P42574 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP3P42574 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP3P42574 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP3P42574 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP3P42574 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP3P42574 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP3P42574 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP3P42574 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP3P42574 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP3P42574 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP3P42574 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP3P42574 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP3P42574 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP3P42574 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP3P42574 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP3P42574 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP3P42574 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP3P42574 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP3P42574 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP3P42574 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP3P42574 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP3P42574 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP3P42574 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP3P42574 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP3P42574 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP3P42574 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP3P42574 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP3P42574 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP3P42574 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP3P42574 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP3P42574 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP3P42574 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP3P42574 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP3P42574 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP3P42574 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP3P42574 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP3P42574 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP3P42574 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP3P42574 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP3P42574 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP3P42574 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP3P42574 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP3P42574 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP3P42574 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP3P42574 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP3P42574 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP3P42574 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP3P42574 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP3P42574 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP3P42574 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP3P42574 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP3P42574 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP3P42574 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP3P42574 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP3P42574 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP3P42574 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP3P42574 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP3P42574 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP3P42574 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP3P42574 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP3P42574 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP3P42574 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP3P42574 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP3P42574 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP3P42574 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP3P42574 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP3P42574 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP3P42574 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP3P42574 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP3P42574 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP3P42574 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP3P42574 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP3P42574 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP3P42574 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms