Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PIK3CBP42338 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms