Protein–RNA interactions for Protein: P36896

ACVR1B, Activin receptor type-1B, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1BP36896 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms