Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms