Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKARP32238 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKARP32238 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKARP32238 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKARP32238 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKARP32238 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKARP32238 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKARP32238 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKARP32238 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKARP32238 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKARP32238 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKARP32238 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKARP32238 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKARP32238 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKARP32238 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKARP32238 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKARP32238 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKARP32238 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKARP32238 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKARP32238 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKARP32238 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKARP32238 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKARP32238 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKARP32238 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKARP32238 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKARP32238 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKARP32238 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKARP32238 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKARP32238 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKARP32238 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCKARP32238 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCKARP32238 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCKARP32238 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCKARP32238 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCKARP32238 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCKARP32238 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCKARP32238 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCKARP32238 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCKARP32238 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCKARP32238 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCKARP32238 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCKARP32238 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCKARP32238 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCKARP32238 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCKARP32238 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCKARP32238 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCKARP32238 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCKARP32238 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCKARP32238 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCKARP32238 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCKARP32238 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCKARP32238 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCKARP32238 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCKARP32238 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCKARP32238 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCKARP32238 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCKARP32238 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCKARP32238 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCKARP32238 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCKARP32238 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCKARP32238 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCKARP32238 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCKARP32238 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCKARP32238 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCKARP32238 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCKARP32238 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCKARP32238 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCKARP32238 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCKARP32238 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCKARP32238 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCKARP32238 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCKARP32238 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCKARP32238 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCKARP32238 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCKARP32238 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCKARP32238 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCKARP32238 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCKARP32238 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCKARP32238 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCKARP32238 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCKARP32238 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCKARP32238 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCKARP32238 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCKARP32238 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCKARP32238 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCKARP32238 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCKARP32238 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCKARP32238 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCKARP32238 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCKARP32238 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCKARP32238 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCKARP32238 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCKARP32238 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCKARP32238 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCKARP32238 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCKARP32238 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCKARP32238 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCKARP32238 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCKARP32238 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCKARP32238 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms