Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CPS1P31327 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CPS1P31327 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CPS1P31327 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CPS1P31327 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CPS1P31327 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CPS1P31327 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CPS1P31327 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CPS1P31327 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CPS1P31327 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CPS1P31327 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CPS1P31327 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CPS1P31327 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CPS1P31327 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CPS1P31327 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CPS1P31327 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CPS1P31327 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CPS1P31327 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CPS1P31327 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CPS1P31327 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CPS1P31327 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CPS1P31327 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CPS1P31327 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CPS1P31327 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CPS1P31327 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CPS1P31327 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CPS1P31327 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CPS1P31327 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CPS1P31327 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CPS1P31327 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CPS1P31327 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CPS1P31327 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CPS1P31327 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CPS1P31327 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CPS1P31327 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CPS1P31327 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CPS1P31327 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CPS1P31327 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CPS1P31327 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CPS1P31327 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CPS1P31327 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CPS1P31327 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CPS1P31327 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CPS1P31327 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CPS1P31327 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CPS1P31327 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CPS1P31327 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CPS1P31327 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CPS1P31327 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CPS1P31327 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CPS1P31327 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CPS1P31327 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CPS1P31327 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CPS1P31327 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CPS1P31327 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CPS1P31327 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CPS1P31327 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CPS1P31327 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CPS1P31327 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CPS1P31327 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CPS1P31327 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CPS1P31327 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CPS1P31327 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CPS1P31327 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CPS1P31327 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CPS1P31327 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CPS1P31327 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CPS1P31327 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CPS1P31327 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CPS1P31327 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CPS1P31327 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CPS1P31327 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CPS1P31327 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CPS1P31327 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CPS1P31327 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CPS1P31327 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CPS1P31327 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CPS1P31327 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CPS1P31327 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CPS1P31327 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CPS1P31327 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CPS1P31327 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CPS1P31327 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CPS1P31327 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CPS1P31327 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CPS1P31327 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CPS1P31327 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CPS1P31327 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CPS1P31327 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CPS1P31327 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CPS1P31327 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CPS1P31327 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CPS1P31327 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CPS1P31327 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CPS1P31327 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CPS1P31327 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CPS1P31327 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CPS1P31327 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CPS1P31327 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CPS1P31327 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms