Protein–RNA interactions for Protein: P28335

HTR2C, 5-hydroxytryptamine receptor 2C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2CP28335 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HTR2CP28335 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms