Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms