Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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