Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPREP23469 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPREP23469 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPREP23469 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPREP23469 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPREP23469 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPREP23469 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPREP23469 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPREP23469 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPREP23469 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPREP23469 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPREP23469 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPREP23469 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPREP23469 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPREP23469 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPREP23469 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPREP23469 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPREP23469 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPREP23469 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPREP23469 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPREP23469 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPREP23469 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPREP23469 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPREP23469 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPREP23469 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPREP23469 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPREP23469 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPREP23469 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPREP23469 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPREP23469 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPREP23469 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPREP23469 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPREP23469 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPREP23469 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPREP23469 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPREP23469 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPREP23469 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPREP23469 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPREP23469 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPREP23469 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPREP23469 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPREP23469 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPREP23469 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPREP23469 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPREP23469 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPREP23469 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPREP23469 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPREP23469 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPREP23469 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPREP23469 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPREP23469 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPREP23469 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPREP23469 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPREP23469 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPREP23469 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPREP23469 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPREP23469 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPREP23469 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPREP23469 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPREP23469 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPREP23469 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPREP23469 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPREP23469 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPREP23469 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPREP23469 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPREP23469 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPREP23469 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPREP23469 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPREP23469 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPREP23469 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPREP23469 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPREP23469 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPREP23469 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPREP23469 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPREP23469 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPREP23469 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPREP23469 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPREP23469 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPREP23469 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPREP23469 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPREP23469 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPREP23469 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPREP23469 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPREP23469 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPREP23469 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPREP23469 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPREP23469 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPREP23469 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPREP23469 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPREP23469 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPREP23469 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPREP23469 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPREP23469 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPREP23469 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPREP23469 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPREP23469 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPREP23469 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPREP23469 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPREP23469 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPREP23469 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
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