Protein–RNA interactions for Protein: P20749

BCL3, B-cell lymphoma 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL3P20749 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BCL3P20749 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
BCL3P20749 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
BCL3P20749 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BCL3P20749 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BCL3P20749 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BCL3P20749 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BCL3P20749 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BCL3P20749 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BCL3P20749 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BCL3P20749 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BCL3P20749 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
BCL3P20749 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BCL3P20749 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BCL3P20749 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
BCL3P20749 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BCL3P20749 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BCL3P20749 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BCL3P20749 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BCL3P20749 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BCL3P20749 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BCL3P20749 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BCL3P20749 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BCL3P20749 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BCL3P20749 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
BCL3P20749 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BCL3P20749 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BCL3P20749 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BCL3P20749 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BCL3P20749 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BCL3P20749 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BCL3P20749 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BCL3P20749 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BCL3P20749 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BCL3P20749 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BCL3P20749 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BCL3P20749 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BCL3P20749 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BCL3P20749 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BCL3P20749 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BCL3P20749 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BCL3P20749 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BCL3P20749 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
BCL3P20749 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BCL3P20749 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BCL3P20749 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BCL3P20749 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BCL3P20749 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BCL3P20749 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
BCL3P20749 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BCL3P20749 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BCL3P20749 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BCL3P20749 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BCL3P20749 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
BCL3P20749 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BCL3P20749 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BCL3P20749 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BCL3P20749 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BCL3P20749 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BCL3P20749 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BCL3P20749 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BCL3P20749 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BCL3P20749 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BCL3P20749 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BCL3P20749 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BCL3P20749 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BCL3P20749 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BCL3P20749 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
BCL3P20749 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BCL3P20749 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BCL3P20749 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BCL3P20749 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BCL3P20749 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BCL3P20749 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BCL3P20749 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BCL3P20749 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BCL3P20749 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BCL3P20749 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BCL3P20749 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
BCL3P20749 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BCL3P20749 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
BCL3P20749 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BCL3P20749 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
BCL3P20749 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
BCL3P20749 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BCL3P20749 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BCL3P20749 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BCL3P20749 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BCL3P20749 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BCL3P20749 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BCL3P20749 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BCL3P20749 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BCL3P20749 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
BCL3P20749 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BCL3P20749 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BCL3P20749 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BCL3P20749 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BCL3P20749 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BCL3P20749 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
BCL3P20749 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms