Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRHP20396 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRHP20396 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRHP20396 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRHP20396 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRHP20396 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRHP20396 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRHP20396 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRHP20396 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TRHP20396 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRHP20396 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TRHP20396 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRHP20396 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRHP20396 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRHP20396 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TRHP20396 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRHP20396 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRHP20396 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRHP20396 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRHP20396 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRHP20396 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRHP20396 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRHP20396 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRHP20396 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRHP20396 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRHP20396 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRHP20396 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRHP20396 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRHP20396 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TRHP20396 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRHP20396 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRHP20396 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRHP20396 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRHP20396 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRHP20396 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRHP20396 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRHP20396 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRHP20396 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRHP20396 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRHP20396 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRHP20396 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRHP20396 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRHP20396 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRHP20396 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRHP20396 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRHP20396 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRHP20396 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRHP20396 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRHP20396 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRHP20396 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRHP20396 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRHP20396 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRHP20396 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRHP20396 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TRHP20396 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRHP20396 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRHP20396 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRHP20396 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRHP20396 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRHP20396 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRHP20396 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TRHP20396 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRHP20396 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRHP20396 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRHP20396 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRHP20396 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRHP20396 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRHP20396 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRHP20396 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TRHP20396 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRHP20396 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRHP20396 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRHP20396 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRHP20396 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRHP20396 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRHP20396 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRHP20396 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRHP20396 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRHP20396 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRHP20396 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRHP20396 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRHP20396 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRHP20396 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRHP20396 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRHP20396 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRHP20396 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRHP20396 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRHP20396 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRHP20396 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRHP20396 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRHP20396 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
TRHP20396 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRHP20396 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRHP20396 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRHP20396 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRHP20396 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
TRHP20396 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRHP20396 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRHP20396 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRHP20396 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
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