Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms