Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VAV1P15498 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VAV1P15498 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VAV1P15498 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
VAV1P15498 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VAV1P15498 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VAV1P15498 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VAV1P15498 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VAV1P15498 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VAV1P15498 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VAV1P15498 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VAV1P15498 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
VAV1P15498 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VAV1P15498 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VAV1P15498 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
VAV1P15498 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VAV1P15498 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VAV1P15498 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VAV1P15498 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VAV1P15498 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VAV1P15498 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VAV1P15498 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VAV1P15498 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
VAV1P15498 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VAV1P15498 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VAV1P15498 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VAV1P15498 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
VAV1P15498 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VAV1P15498 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VAV1P15498 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VAV1P15498 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VAV1P15498 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VAV1P15498 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VAV1P15498 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VAV1P15498 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VAV1P15498 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VAV1P15498 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VAV1P15498 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VAV1P15498 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VAV1P15498 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VAV1P15498 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
VAV1P15498 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VAV1P15498 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAV1P15498 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAV1P15498 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAV1P15498 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAV1P15498 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAV1P15498 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAV1P15498 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAV1P15498 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAV1P15498 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAV1P15498 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAV1P15498 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAV1P15498 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAV1P15498 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAV1P15498 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAV1P15498 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAV1P15498 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAV1P15498 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAV1P15498 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAV1P15498 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
VAV1P15498 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAV1P15498 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAV1P15498 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
VAV1P15498 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAV1P15498 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
VAV1P15498 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAV1P15498 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAV1P15498 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAV1P15498 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAV1P15498 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAV1P15498 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAV1P15498 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAV1P15498 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAV1P15498 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAV1P15498 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAV1P15498 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAV1P15498 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAV1P15498 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAV1P15498 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAV1P15498 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAV1P15498 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAV1P15498 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAV1P15498 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAV1P15498 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAV1P15498 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAV1P15498 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAV1P15498 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAV1P15498 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAV1P15498 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAV1P15498 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAV1P15498 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAV1P15498 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAV1P15498 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAV1P15498 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAV1P15498 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAV1P15498 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAV1P15498 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAV1P15498 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAV1P15498 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms