Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms