Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ODC1P11926 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ODC1P11926 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ODC1P11926 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ODC1P11926 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ODC1P11926 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ODC1P11926 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ODC1P11926 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ODC1P11926 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ODC1P11926 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ODC1P11926 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ODC1P11926 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ODC1P11926 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ODC1P11926 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ODC1P11926 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ODC1P11926 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ODC1P11926 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ODC1P11926 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ODC1P11926 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ODC1P11926 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ODC1P11926 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ODC1P11926 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ODC1P11926 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ODC1P11926 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ODC1P11926 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ODC1P11926 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ODC1P11926 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ODC1P11926 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ODC1P11926 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ODC1P11926 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ODC1P11926 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ODC1P11926 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ODC1P11926 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ODC1P11926 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ODC1P11926 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ODC1P11926 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ODC1P11926 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ODC1P11926 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ODC1P11926 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ODC1P11926 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ODC1P11926 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ODC1P11926 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ODC1P11926 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ODC1P11926 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ODC1P11926 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ODC1P11926 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ODC1P11926 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ODC1P11926 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ODC1P11926 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ODC1P11926 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ODC1P11926 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ODC1P11926 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ODC1P11926 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ODC1P11926 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ODC1P11926 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ODC1P11926 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ODC1P11926 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ODC1P11926 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ODC1P11926 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ODC1P11926 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ODC1P11926 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ODC1P11926 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ODC1P11926 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ODC1P11926 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ODC1P11926 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ODC1P11926 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ODC1P11926 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ODC1P11926 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ODC1P11926 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ODC1P11926 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ODC1P11926 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ODC1P11926 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ODC1P11926 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ODC1P11926 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ODC1P11926 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ODC1P11926 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ODC1P11926 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ODC1P11926 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ODC1P11926 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ODC1P11926 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ODC1P11926 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ODC1P11926 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ODC1P11926 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ODC1P11926 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ODC1P11926 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ODC1P11926 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ODC1P11926 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ODC1P11926 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ODC1P11926 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ODC1P11926 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ODC1P11926 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ODC1P11926 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ODC1P11926 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ODC1P11926 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ODC1P11926 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ODC1P11926 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ODC1P11926 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ODC1P11926 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ODC1P11926 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ODC1P11926 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms