Protein–RNA interactions for Protein: P09884

POLA1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLA1P09884 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
POLA1P09884 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
POLA1P09884 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
POLA1P09884 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
POLA1P09884 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
POLA1P09884 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
POLA1P09884 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
POLA1P09884 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
POLA1P09884 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
POLA1P09884 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
POLA1P09884 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
POLA1P09884 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
POLA1P09884 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
POLA1P09884 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
POLA1P09884 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
POLA1P09884 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
POLA1P09884 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
POLA1P09884 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
POLA1P09884 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
POLA1P09884 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
POLA1P09884 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
POLA1P09884 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
POLA1P09884 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
POLA1P09884 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
POLA1P09884 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
POLA1P09884 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
POLA1P09884 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
POLA1P09884 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
POLA1P09884 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
POLA1P09884 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
POLA1P09884 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
POLA1P09884 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
POLA1P09884 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
POLA1P09884 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
POLA1P09884 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
POLA1P09884 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
POLA1P09884 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
POLA1P09884 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
POLA1P09884 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
POLA1P09884 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
POLA1P09884 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
POLA1P09884 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
POLA1P09884 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
POLA1P09884 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
POLA1P09884 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
POLA1P09884 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
POLA1P09884 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
POLA1P09884 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
POLA1P09884 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
POLA1P09884 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
POLA1P09884 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
POLA1P09884 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
POLA1P09884 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
POLA1P09884 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
POLA1P09884 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
POLA1P09884 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
POLA1P09884 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
POLA1P09884 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
POLA1P09884 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
POLA1P09884 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
POLA1P09884 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
POLA1P09884 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
POLA1P09884 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
POLA1P09884 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
POLA1P09884 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
POLA1P09884 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
POLA1P09884 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
POLA1P09884 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
POLA1P09884 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
POLA1P09884 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
POLA1P09884 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
POLA1P09884 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
POLA1P09884 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
POLA1P09884 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
POLA1P09884 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
POLA1P09884 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
POLA1P09884 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
POLA1P09884 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
POLA1P09884 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
POLA1P09884 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
POLA1P09884 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
POLA1P09884 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
POLA1P09884 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
POLA1P09884 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
POLA1P09884 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
POLA1P09884 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
POLA1P09884 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
POLA1P09884 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
POLA1P09884 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
POLA1P09884 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
POLA1P09884 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
POLA1P09884 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
POLA1P09884 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
POLA1P09884 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
POLA1P09884 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
POLA1P09884 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
POLA1P09884 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
POLA1P09884 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
POLA1P09884 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
POLA1P09884 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms