Protein–RNA interactions for Protein: P09067

HOXB5, Homeobox protein Hox-B5, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB5P09067 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB5P09067 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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