Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HSP90AB1P08238 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HSP90AB1P08238 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HSP90AB1P08238 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HSP90AB1P08238 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HSP90AB1P08238 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HSP90AB1P08238 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HSP90AB1P08238 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HSP90AB1P08238 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HSP90AB1P08238 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HSP90AB1P08238 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HSP90AB1P08238 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HSP90AB1P08238 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HSP90AB1P08238 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HSP90AB1P08238 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HSP90AB1P08238 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HSP90AB1P08238 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HSP90AB1P08238 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HSP90AB1P08238 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HSP90AB1P08238 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HSP90AB1P08238 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HSP90AB1P08238 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HSP90AB1P08238 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HSP90AB1P08238 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HSP90AB1P08238 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HSP90AB1P08238 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HSP90AB1P08238 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HSP90AB1P08238 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HSP90AB1P08238 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HSP90AB1P08238 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HSP90AB1P08238 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HSP90AB1P08238 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HSP90AB1P08238 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HSP90AB1P08238 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HSP90AB1P08238 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HSP90AB1P08238 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HSP90AB1P08238 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HSP90AB1P08238 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HSP90AB1P08238 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HSP90AB1P08238 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HSP90AB1P08238 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HSP90AB1P08238 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HSP90AB1P08238 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HSP90AB1P08238 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HSP90AB1P08238 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HSP90AB1P08238 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HSP90AB1P08238 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HSP90AB1P08238 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HSP90AB1P08238 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HSP90AB1P08238 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HSP90AB1P08238 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HSP90AB1P08238 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HSP90AB1P08238 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HSP90AB1P08238 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HSP90AB1P08238 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HSP90AB1P08238 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HSP90AB1P08238 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HSP90AB1P08238 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HSP90AB1P08238 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HSP90AB1P08238 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HSP90AB1P08238 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HSP90AB1P08238 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HSP90AB1P08238 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HSP90AB1P08238 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HSP90AB1P08238 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HSP90AB1P08238 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HSP90AB1P08238 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HSP90AB1P08238 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HSP90AB1P08238 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HSP90AB1P08238 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HSP90AB1P08238 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HSP90AB1P08238 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HSP90AB1P08238 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HSP90AB1P08238 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
HSP90AB1P08238 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms