Protein–RNA interactions for Protein: P05014

IFNA4, Interferon alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA4P05014 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFNA4P05014 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFNA4P05014 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFNA4P05014 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFNA4P05014 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFNA4P05014 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFNA4P05014 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
IFNA4P05014 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFNA4P05014 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFNA4P05014 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFNA4P05014 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFNA4P05014 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFNA4P05014 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFNA4P05014 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFNA4P05014 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFNA4P05014 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
IFNA4P05014 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFNA4P05014 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFNA4P05014 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFNA4P05014 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFNA4P05014 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFNA4P05014 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFNA4P05014 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFNA4P05014 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFNA4P05014 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFNA4P05014 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFNA4P05014 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFNA4P05014 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFNA4P05014 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFNA4P05014 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFNA4P05014 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
IFNA4P05014 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
IFNA4P05014 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFNA4P05014 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFNA4P05014 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
IFNA4P05014 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFNA4P05014 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFNA4P05014 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFNA4P05014 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFNA4P05014 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFNA4P05014 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
IFNA4P05014 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFNA4P05014 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFNA4P05014 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFNA4P05014 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFNA4P05014 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFNA4P05014 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFNA4P05014 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFNA4P05014 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFNA4P05014 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFNA4P05014 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFNA4P05014 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFNA4P05014 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFNA4P05014 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFNA4P05014 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFNA4P05014 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFNA4P05014 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFNA4P05014 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFNA4P05014 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFNA4P05014 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFNA4P05014 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFNA4P05014 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFNA4P05014 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFNA4P05014 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFNA4P05014 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFNA4P05014 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFNA4P05014 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFNA4P05014 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
IFNA4P05014 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFNA4P05014 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFNA4P05014 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFNA4P05014 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFNA4P05014 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFNA4P05014 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
IFNA4P05014 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
IFNA4P05014 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFNA4P05014 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFNA4P05014 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFNA4P05014 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFNA4P05014 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFNA4P05014 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFNA4P05014 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFNA4P05014 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFNA4P05014 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFNA4P05014 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFNA4P05014 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFNA4P05014 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFNA4P05014 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFNA4P05014 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFNA4P05014 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFNA4P05014 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFNA4P05014 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFNA4P05014 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFNA4P05014 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
IFNA4P05014 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFNA4P05014 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFNA4P05014 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFNA4P05014 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFNA4P05014 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFNA4P05014 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms