Protein–RNA interactions for Protein: O95164

UBL3, Ubiquitin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL3O95164 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBL3O95164 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBL3O95164 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBL3O95164 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBL3O95164 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBL3O95164 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBL3O95164 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBL3O95164 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBL3O95164 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBL3O95164 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBL3O95164 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBL3O95164 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBL3O95164 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBL3O95164 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBL3O95164 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBL3O95164 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBL3O95164 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBL3O95164 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBL3O95164 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBL3O95164 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBL3O95164 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
UBL3O95164 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBL3O95164 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBL3O95164 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBL3O95164 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBL3O95164 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBL3O95164 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBL3O95164 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBL3O95164 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBL3O95164 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBL3O95164 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBL3O95164 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBL3O95164 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBL3O95164 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBL3O95164 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBL3O95164 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBL3O95164 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBL3O95164 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBL3O95164 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBL3O95164 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
UBL3O95164 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBL3O95164 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBL3O95164 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBL3O95164 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBL3O95164 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBL3O95164 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBL3O95164 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBL3O95164 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBL3O95164 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBL3O95164 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBL3O95164 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBL3O95164 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBL3O95164 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBL3O95164 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBL3O95164 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBL3O95164 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBL3O95164 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBL3O95164 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBL3O95164 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBL3O95164 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBL3O95164 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBL3O95164 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBL3O95164 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBL3O95164 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBL3O95164 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBL3O95164 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBL3O95164 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBL3O95164 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBL3O95164 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBL3O95164 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBL3O95164 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBL3O95164 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
UBL3O95164 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBL3O95164 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBL3O95164 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBL3O95164 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBL3O95164 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBL3O95164 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBL3O95164 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBL3O95164 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBL3O95164 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBL3O95164 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBL3O95164 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBL3O95164 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
UBL3O95164 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBL3O95164 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBL3O95164 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBL3O95164 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBL3O95164 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBL3O95164 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBL3O95164 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBL3O95164 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBL3O95164 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBL3O95164 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBL3O95164 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBL3O95164 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBL3O95164 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBL3O95164 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBL3O95164 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBL3O95164 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms