Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 DIS3-201ENST00000377767 10604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.085e-6■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 RAVER2-203ENST00000418058 2531 ntTSL 28.22□□□□□ -1.095e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 PCID2-214ENST00000491548 654 ntTSL 28.08□□□□□ -1.125e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 SLC25A12-203ENST00000426896 911 ntTSL 28.08□□□□□ -1.125e-6■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 ALPK1-201ENST00000177648 4537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.125e-6■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 ATG4D-210ENST00000588972 632 ntTSL 57.99□□□□□ -1.135e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 ZNF225-201ENST00000262894 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.155e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 RNF213-213ENST00000571908 624 ntTSL 27.83□□□□□ -1.165e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 DNM1L-207ENST00000452533 4439 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.165e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 NLRP2-213ENST00000542755 1772 ntTSL 27.72□□□□□ -1.175e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 ALG13-224ENST00000610588 4175 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.195e-6■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 RPN2-205ENST00000456102 791 ntTSL 37.58□□□□□ -1.25e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 RNMT-210ENST00000593007 811 ntTSL 47.54□□□□□ -1.25e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 CEP120-206ENST00000508442 2645 ntTSL 27.54□□□□□ -1.22e-6■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 GATAD2B-204ENST00000634544 2342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.25e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 DNM1L-203ENST00000381000 4397 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.215e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 DNM1L-202ENST00000358214 3229 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.215e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 DNM1L-209ENST00000546757 2661 ntTSL 57.49□□□□□ -1.215e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 TTLL4-210ENST00000442769 3971 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.217e-9■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 KIAA0586-201ENST00000261244 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.225e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 NUP107-211ENST00000539906 3004 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.285e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 EFCAB11-203ENST00000550103 647 ntTSL 37.01□□□□□ -1.292e-6■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 DNM1L-205ENST00000414834 4211 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.295e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 CEP120-202ENST00000306481 4629 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.32e-6■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 PCSK6-206ENST00000558864 3868 ntTSL 26.9□□□□□ -1.315e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 KIAA0586-214ENST00000619416 8233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.315e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 RPL23A-201ENST00000355731 587 ntTSL 56.77□□□□□ -1.325e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 ARV1-206ENST00000480519 1037 ntTSL 56.76□□□□□ -1.334e-6■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 AL359644.1-204ENST00000440807 440 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.345e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 SNX10-205ENST00000412416 429 ntTSL 36.63□□□□□ -1.355e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 PEX19-207ENST00000524939 548 ntTSL 26.52□□□□□ -1.375e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.395e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.395e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.45e-6■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.425e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 GTF3C6-202ENST00000480191 800 ntTSL 36.13□□□□□ -1.435e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 GATAD2B-209ENST00000636014 187 ntTSL 56.05□□□□□ -1.445e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 STAT1-206ENST00000423282 477 ntTSL 36.05□□□□□ -1.445e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 PHF20L1-215ENST00000486199 1633 ntTSL 25.75□□□□□ -1.495e-6■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 SNX25-203ENST00000504959 1868 ntTSL 25.72□□□□□ -1.495e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 MPC1-205ENST00000487218 918 ntTSL 55.66□□□□□ -1.52e-6■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 ALPK1-213ENST00000509688 2749 ntTSL 25.64□□□□□ -1.515e-6■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.515e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.535e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.552e-6■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 ALG13-239ENST00000636363 3480 ntTSL 55.3□□□□□ -1.565e-6■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 PCID2-211ENST00000475433 776 ntTSL 55.24□□□□□ -1.575e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 UCP2-204ENST00000539764 464 ntTSL 35.04□□□□□ -1.65e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 ALG13-234ENST00000624161 3761 ntTSL 25.04□□□□□ -1.65e-6■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 SNX25-206ENST00000513433 748 ntTSL 35.01□□□□□ -1.615e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.615e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.645e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 CEP120-205ENST00000508138 4720 ntTSL 1 (best)4.5□□□□□ -1.692e-6■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 DYM-214ENST00000582399 366 ntTSL 1 (best)4.46□□□□□ -1.695e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 AP2A2-209ENST00000526753 464 ntTSL 44.32□□□□□ -1.725e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.735e-6■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 ARV1-202ENST00000366658 1170 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.744e-6■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.755e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 BTN3A1-205ENST00000427334 570 ntTSL 44.12□□□□□ -1.755e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 DNM1L-228ENST00000552743 606 ntTSL 44.09□□□□□ -1.755e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.792e-6■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.795e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.815e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 BTN3A1-207ENST00000465690 584 ntTSL 43.73□□□□□ -1.815e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 ALG13-209ENST00000470971 3200 ntTSL 53.67□□□□□ -1.825e-6■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.835e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.832e-6■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.845e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 RPL23A-207ENST00000578181 593 ntTSL 23.48□□□□□ -1.855e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 PHF20L1-212ENST00000469979 7822 ntTSL 23.43□□□□□ -1.865e-6■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 RBM25-206ENST00000527449 3469 ntTSL 1 (best)3.4□□□□□ -1.865e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 PCID2-212ENST00000480971 701 ntTSL 53.37□□□□□ -1.875e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.875e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 RSRC1-212ENST00000482822 792 ntTSL 23.33□□□□□ -1.883e-6■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 EFCAB11-213ENST00000557685 698 ntTSL 33.32□□□□□ -1.882e-6■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 KIAA0586-204ENST00000538571 4232 ntTSL 53.3□□□□□ -1.885e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 DNM1L-210ENST00000547078 450 ntTSL 43.29□□□□□ -1.885e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 RNF14-214ENST00000513019 563 ntTSL 33.21□□□□□ -1.895e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 AC093157.1-206ENST00000451213 1531 ntTSL 23.06□□□□□ -1.925e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.945e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 EFCAB11-204ENST00000553871 624 ntTSL 52.74□□□□□ -1.972e-6■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 MPC1-204ENST00000475708 651 ntTSL 52.68□□□□□ -1.982e-6■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 ALPK1-202ENST00000426472 549 ntTSL 42.31□□□□□ -2.045e-6■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 TCIRG1-210ENST00000530063 220 ntTSL 1 (best)2.15□□□□□ -2.075e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 STAG2-217ENST00000475602 356 ntTSL 31.65□□□□□ -2.155e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 DNM1L-216ENST00000548151 557 ntTSL 41.23□□□□□ -2.215e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 CREBBP-218ENST00000636895 100 ntTSL 5-0.19□□□□□ -2.442e-6■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.367e-7■■■■■ 120.5
SF3B1O75533 DCAF8-207ENST00000447377 728 ntTSL 219.82■□□□□ 0.767e-7■■■■■ 120.5
SF3B1O75533 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.597e-7■■■■■ 120.5
SF3B1O75533 DCAF8-205ENST00000419626 439 ntTSL 213.3□□□□□ -0.287e-7■■■■■ 120.5
SF3B1O75533 DCAF8-204ENST00000407642 517 ntTSL 211.52□□□□□ -0.577e-7■■■■■ 120.5
SF3B1O75533 DCAF8-216ENST00000495887 919 ntTSL 311.07□□□□□ -0.647e-7■■■■■ 120.5
SF3B1O75533 DCAF8-206ENST00000440682 501 ntTSL 38.02□□□□□ -1.137e-7■■■■■ 120.5
SF3B1O75533 WWOX-215ENST00000569332 1856 ntTSL 225■■□□□ 1.594e-6■■■■■ 120.5
SF3B1O75533 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.934e-6■■■■■ 120.5
SF3B1O75533 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.914e-6■■■■■ 120.5
SF3B1O75533 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.674e-6■■■■■ 120.5
SF3B1O75533 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.644e-6■■■■■ 120.5
SF3B1O75533 WDR48-201ENST00000302313 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.234e-7■■■■■ 120.5
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