Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC27.56■■■□□ 2
KIAA0556O60303 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KIAA0556O60303 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KIAA0556O60303 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
KIAA0556O60303 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
KIAA0556O60303 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KIAA0556O60303 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KIAA0556O60303 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KIAA0556O60303 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
KIAA0556O60303 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KIAA0556O60303 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KIAA0556O60303 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC27.55■■■□□ 2
KIAA0556O60303 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
KIAA0556O60303 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC27.55■■■□□ 2
KIAA0556O60303 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
KIAA0556O60303 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC27.55■■■□□ 2
KIAA0556O60303 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
KIAA0556O60303 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
KIAA0556O60303 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
KIAA0556O60303 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
KIAA0556O60303 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KIAA0556O60303 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KIAA0556O60303 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KIAA0556O60303 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KIAA0556O60303 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KIAA0556O60303 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
KIAA0556O60303 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KIAA0556O60303 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KIAA0556O60303 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KIAA0556O60303 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
KIAA0556O60303 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC27.54■■■□□ 2
KIAA0556O60303 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
KIAA0556O60303 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
KIAA0556O60303 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KIAA0556O60303 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC27.54■■■□□ 2
KIAA0556O60303 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KIAA0556O60303 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
KIAA0556O60303 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KIAA0556O60303 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KIAA0556O60303 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
KIAA0556O60303 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
KIAA0556O60303 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KIAA0556O60303 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KIAA0556O60303 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KIAA0556O60303 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KIAA0556O60303 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KIAA0556O60303 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KIAA0556O60303 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
KIAA0556O60303 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC27.53■■■□□ 2
KIAA0556O60303 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
KIAA0556O60303 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
KIAA0556O60303 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KIAA0556O60303 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KIAA0556O60303 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KIAA0556O60303 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KIAA0556O60303 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
KIAA0556O60303 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
KIAA0556O60303 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KIAA0556O60303 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
KIAA0556O60303 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
KIAA0556O60303 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
KIAA0556O60303 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KIAA0556O60303 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KIAA0556O60303 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
KIAA0556O60303 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
KIAA0556O60303 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
KIAA0556O60303 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
KIAA0556O60303 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KIAA0556O60303 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
KIAA0556O60303 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
KIAA0556O60303 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KIAA0556O60303 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
KIAA0556O60303 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
KIAA0556O60303 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
KIAA0556O60303 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KIAA0556O60303 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KIAA0556O60303 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KIAA0556O60303 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KIAA0556O60303 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
KIAA0556O60303 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
KIAA0556O60303 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
KIAA0556O60303 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
KIAA0556O60303 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
KIAA0556O60303 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC27.52■■■□□ 2
KIAA0556O60303 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
KIAA0556O60303 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KIAA0556O60303 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KIAA0556O60303 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
KIAA0556O60303 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
KIAA0556O60303 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms