Protein–RNA interactions for Protein: O43567

RNF13, E3 ubiquitin-protein ligase RNF13, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF13O43567 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF13O43567 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF13O43567 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF13O43567 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF13O43567 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF13O43567 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF13O43567 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF13O43567 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF13O43567 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF13O43567 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF13O43567 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF13O43567 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF13O43567 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF13O43567 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF13O43567 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF13O43567 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF13O43567 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF13O43567 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF13O43567 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF13O43567 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF13O43567 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF13O43567 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF13O43567 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF13O43567 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF13O43567 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF13O43567 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF13O43567 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF13O43567 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF13O43567 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF13O43567 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF13O43567 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF13O43567 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF13O43567 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF13O43567 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF13O43567 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF13O43567 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF13O43567 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF13O43567 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF13O43567 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF13O43567 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF13O43567 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF13O43567 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF13O43567 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF13O43567 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF13O43567 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF13O43567 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF13O43567 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF13O43567 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF13O43567 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF13O43567 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF13O43567 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF13O43567 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF13O43567 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF13O43567 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF13O43567 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF13O43567 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF13O43567 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF13O43567 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF13O43567 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF13O43567 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF13O43567 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF13O43567 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF13O43567 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF13O43567 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF13O43567 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF13O43567 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF13O43567 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF13O43567 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF13O43567 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF13O43567 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF13O43567 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF13O43567 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF13O43567 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF13O43567 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF13O43567 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF13O43567 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF13O43567 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF13O43567 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF13O43567 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF13O43567 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF13O43567 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF13O43567 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF13O43567 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF13O43567 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF13O43567 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF13O43567 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF13O43567 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF13O43567 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF13O43567 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF13O43567 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF13O43567 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF13O43567 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF13O43567 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF13O43567 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF13O43567 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF13O43567 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF13O43567 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF13O43567 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF13O43567 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF13O43567 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms