Protein–RNA interactions for Protein: O15054

KDM6B, Lysine-specific demethylase 6B, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6BO15054 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KDM6BO15054 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms