Protein–RNA interactions for Protein: O00472

ELL2, RNA polymerase II elongation factor ELL2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL2O00472 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ELL2O00472 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ELL2O00472 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ELL2O00472 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ELL2O00472 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ELL2O00472 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ELL2O00472 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ELL2O00472 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ELL2O00472 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ELL2O00472 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ELL2O00472 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ELL2O00472 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ELL2O00472 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ELL2O00472 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ELL2O00472 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ELL2O00472 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ELL2O00472 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ELL2O00472 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ELL2O00472 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ELL2O00472 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ELL2O00472 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ELL2O00472 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ELL2O00472 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ELL2O00472 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ELL2O00472 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ELL2O00472 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ELL2O00472 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ELL2O00472 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ELL2O00472 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ELL2O00472 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ELL2O00472 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ELL2O00472 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ELL2O00472 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ELL2O00472 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ELL2O00472 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ELL2O00472 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ELL2O00472 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ELL2O00472 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ELL2O00472 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ELL2O00472 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ELL2O00472 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ELL2O00472 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ELL2O00472 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ELL2O00472 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ELL2O00472 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ELL2O00472 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ELL2O00472 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ELL2O00472 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ELL2O00472 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ELL2O00472 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ELL2O00472 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ELL2O00472 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ELL2O00472 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ELL2O00472 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ELL2O00472 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ELL2O00472 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ELL2O00472 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ELL2O00472 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ELL2O00472 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ELL2O00472 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ELL2O00472 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ELL2O00472 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ELL2O00472 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ELL2O00472 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ELL2O00472 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ELL2O00472 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ELL2O00472 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ELL2O00472 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ELL2O00472 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ELL2O00472 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ELL2O00472 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ELL2O00472 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ELL2O00472 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ELL2O00472 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ELL2O00472 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ELL2O00472 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ELL2O00472 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ELL2O00472 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ELL2O00472 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ELL2O00472 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ELL2O00472 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ELL2O00472 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ELL2O00472 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ELL2O00472 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ELL2O00472 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ELL2O00472 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ELL2O00472 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ELL2O00472 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ELL2O00472 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ELL2O00472 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ELL2O00472 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ELL2O00472 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ELL2O00472 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ELL2O00472 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ELL2O00472 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ELL2O00472 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ELL2O00472 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ELL2O00472 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ELL2O00472 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ELL2O00472 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms