Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KNCNA6PVL3 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms