Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TTLL13PA6NNM8 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TTLL13PA6NNM8 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TTLL13PA6NNM8 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TTLL13PA6NNM8 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TTLL13PA6NNM8 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TTLL13PA6NNM8 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTLL13PA6NNM8 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTLL13PA6NNM8 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTLL13PA6NNM8 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTLL13PA6NNM8 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTLL13PA6NNM8 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TTLL13PA6NNM8 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTLL13PA6NNM8 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTLL13PA6NNM8 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTLL13PA6NNM8 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTLL13PA6NNM8 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTLL13PA6NNM8 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTLL13PA6NNM8 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TTLL13PA6NNM8 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTLL13PA6NNM8 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTLL13PA6NNM8 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTLL13PA6NNM8 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTLL13PA6NNM8 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTLL13PA6NNM8 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTLL13PA6NNM8 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTLL13PA6NNM8 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTLL13PA6NNM8 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTLL13PA6NNM8 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTLL13PA6NNM8 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTLL13PA6NNM8 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TTLL13PA6NNM8 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTLL13PA6NNM8 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTLL13PA6NNM8 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTLL13PA6NNM8 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTLL13PA6NNM8 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTLL13PA6NNM8 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTLL13PA6NNM8 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTLL13PA6NNM8 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTLL13PA6NNM8 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTLL13PA6NNM8 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTLL13PA6NNM8 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TTLL13PA6NNM8 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTLL13PA6NNM8 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTLL13PA6NNM8 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTLL13PA6NNM8 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTLL13PA6NNM8 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTLL13PA6NNM8 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTLL13PA6NNM8 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTLL13PA6NNM8 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTLL13PA6NNM8 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTLL13PA6NNM8 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTLL13PA6NNM8 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TTLL13PA6NNM8 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TTLL13PA6NNM8 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTLL13PA6NNM8 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTLL13PA6NNM8 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTLL13PA6NNM8 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TTLL13PA6NNM8 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TTLL13PA6NNM8 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTLL13PA6NNM8 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTLL13PA6NNM8 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTLL13PA6NNM8 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTLL13PA6NNM8 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTLL13PA6NNM8 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTLL13PA6NNM8 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TTLL13PA6NNM8 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTLL13PA6NNM8 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTLL13PA6NNM8 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTLL13PA6NNM8 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTLL13PA6NNM8 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTLL13PA6NNM8 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTLL13PA6NNM8 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTLL13PA6NNM8 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTLL13PA6NNM8 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTLL13PA6NNM8 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTLL13PA6NNM8 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTLL13PA6NNM8 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTLL13PA6NNM8 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TTLL13PA6NNM8 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTLL13PA6NNM8 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTLL13PA6NNM8 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTLL13PA6NNM8 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTLL13PA6NNM8 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTLL13PA6NNM8 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTLL13PA6NNM8 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTLL13PA6NNM8 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TTLL13PA6NNM8 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTLL13PA6NNM8 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TTLL13PA6NNM8 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TTLL13PA6NNM8 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TTLL13PA6NNM8 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTLL13PA6NNM8 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTLL13PA6NNM8 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTLL13PA6NNM8 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TTLL13PA6NNM8 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TTLL13PA6NNM8 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TTLL13PA6NNM8 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TTLL13PA6NNM8 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TTLL13PA6NNM8 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms