Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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ARL2-SNX15V9GYD0 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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ARL2-SNX15V9GYD0 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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ARL2-SNX15V9GYD0 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
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ARL2-SNX15V9GYD0 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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ARL2-SNX15V9GYD0 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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ARL2-SNX15V9GYD0 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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ARL2-SNX15V9GYD0 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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ARL2-SNX15V9GYD0 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
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