Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y679

AUP1, Ancient ubiquitous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1Q9Y679 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms